全自動軟水器的工作原理是采用一種叫離子交換的方法，除去水中鈣鎂離子的傳統工藝，離子交換樹脂是一種聚合物，帶有相應的功能基團。比如鈉離子交換樹脂表示帶有大量的鈉離子。

當全自動軟水器水中的鈣鎂離子含量高時，離子交換樹脂可以釋放出鈉離子，功能基團與鈣鎂離子結合，這樣水中的鈣鎂離子含量下降，水的硬度下降。硬水就變成了軟水，這就是軟化水設備的工作過程。

當全自動軟水器再生完至下次失效的產水量，與樹脂的工作交換容量、樹脂填充量、原水的硬度及軟化器的工作狀況有關。全自動軟水器再生周期的計算方法則是：

周期產水量（m3）＝有效樹脂填充量（L）×樹脂工作交換容量（mol/L）÷全硬度（mg/L CaCO3）×50

再生周期＝周期產水量÷額定出水量樹脂工作交換容量(mol/L)

全自動軟水器是離子交換反應的載體由骨架和活性基團兩部分組成，通過離子交換反應，交換基團中的可游動離子和水中同性離子進行交換，從而將水中的大部分離子除去，使水質達到脫鹽提純的目的。

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